提速近10倍!基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日,中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用,将助力深度学习在全基因组选择中的应用,为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物(Molecular Plant)》上。
全基因组选择作为新一代育种技术,通过构建预测模型,根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择,从而缩短育种世代间隔,加快育种进程,节约成本,推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心,极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型,难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型,非线性模型(如深度网络神经)具备分析复杂非加性效应的能力,人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机,深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料,通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比,该方法有以下优点: 可以利用多组学数据开展全基因组预测;算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构,可以有效降低模型错误率,提高运行速度;预测精度稳健,在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当,在大规模数据集上预测优势更加明显;计算时间与传统方法相近,比已有深度学习方法提速近10倍;超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
河北:提振消费信心******
【坚定信心 勇毅前行⑫】
光明日报记者 耿建扩 陈元秋
1月1日,在河北省廊坊市明珠商厦,红彤彤的灯笼、中国结和福字等将商场装扮得红红火火,各大柜台前的顾客络绎不绝。连日来,河北各地各部门立足当下、着眼长远,采取一系列促消费政策举措,进一步提振消费信心,释放消费潜力,拉动消费增长。
年终岁末,石家庄启动购物节暨首届特色街区购物节系列活动。市、县两级政府投入1.041亿元资金,以发放消费券或补贴等形式开展促销。自购物节启动以来,石家庄市各大商圈人气逐步回升。
邢台市依托元旦、春节消费旺季,举办“幸福河北欢乐购”消费促进活动,组织家电企业开展家电嘉年华、家电下乡、以旧换新让利促销活动;同时,组织电商企业开展“线上购物节”“区域(特色)网购节”“网上年货节”等促销活动。
为进一步发展新型消费,促进传统商贸转型升级,河北省直播电商节于2022年12月23日启动。活动期间,河北省商务厅组织头部电商平台开通以“2022年河北直播电商节”命名的专页、专区、专项活动,在话题流量和页面展现方面给予支持。
河北省商务厅有关负责人介绍,河北开展网上年货节、特色产品展等系列线上线下促销活动,鼓励各地市继续发放零售业、餐饮、文旅、住宿、体育等领域消费券。持续提升传统消费,开展家用新车促销、以旧换新、汽车下乡和新能源汽车推广等促消费活动。加快培育新型消费,支持传统商业企业加快数字化、智能化改造和跨界融合,鼓励商圈、步行街、大型商贸流通企业引进国内外品牌首店、旗舰店、体验店。优化消费平台载体,持续推进一刻钟便民生活圈建设。
《光明日报》( 2023年01月04日 01版)